Última atualização em 15 de maio de 2016
Ultimate Mortal Kombat 3 é uma atualização de MK3 que apresenta um sistema de jogo alterado, o retorno de alguns personagens favoritos como Kitana e Scorpion (ausentes em MK3), e algumas novas funcionalidades. O jogo foi lançado para diversos sistemas baseado na versão original de Arcade. Algumas versões foram lançadas com títulos diferentes: Mortal Kombat Advance (Game Boy Advance) em 2001 e Ultimate Mortal Kombat (Nintendo DS) em 2007.
Dois novos modos foram introduzidos em UMK3: O modo 2 on 2 e um novo modo de torneio para até oito jogadores. Diversos recursos foram adicionados e alterados. Em adição, o jogo apresenta a dificuldade "Master" no qual o jogador pode enfrentar até três oponentes em uma determinada rodada. Para equilibrar o game, alguns personagens receberam novos movimentos e alguns movimentos existentes foram alterados. Alguns personagens ganharam novos combos, e alguns ataques em sequência foram modificados para causar menos danos.
Ultimate Mortal Kombat 3 apresenta vários novos cenários: Scorpion's Lair/Hell (este estágio contém um novo Stage Fatality, onde o vencedor pode enviar o adversário em um rio de lava); Jade's Desert (uma referência ao seu final em MK3); River Kombat/The Waterfront, Kahn's Kave/The Cavern e Blue Portal/Lost (uma combinação do fundo da tela de "Choose Your Destiny", a ponte the Pit 3 e as montanhas e ponte do poço de Pit II de Mortal Kombat II); Noob's Dorfen (baseado no estágio Balcony, que agora pode ser escolhido usando um Kombat Kode sem ter que lutar com Noob Saibot).