Última atualização em 21 de outubro de 2017
O enredo de Syphon Filter se concentra nos agentes especiais Gabriel "Gabe" Logan e Lian Xing, que devem neutralizar os terroristas que ameaçam Washington D.C e destruir uma arma biológica que foi construída para acabar com a vida de milhões de pessoas inocentes.
O jogo é apresentado em uma perspectiva de terceira pessoa, e o jogador pode mover-se livremente pelo cenário tridimensional e girar a câmera em qualquer direção. Um radar localizado no canto inferior esquerdo da tela exibe a localização de vários objetos, incluindo unidades amigáveis, inimigos, armas ou objetivos da missão. A arma atual equipada é sempre exibida no canto inferior direito, com a contagem de munições. Dependendo da arma usada, a câmera mudará para o modo de primeira pessoa para auxiliar na mira.
O núcleo da jogabilidade de Syphon Filter está focado em táticas baseadas no stealth, que exige que alguém remova furtivamente os inimigos usando armas silenciadas ou outros ataques letais. No entanto, a maior parte do jogo é orientada para a ação, que envolve o Logan navegando através das fases enquanto atira em inimigos sem nenhuma consequência para a missão. O jogo ocorre em uma grande variedade de locais, incluindo ruas estreitas de Washington D.C. até planícies abertas do Cazaquistão.