Última atualização em 9 de setembro de 2018
Situado no ano futurista de 2636, o medonho Red Falcon, que se acredita ter sido destruído há muito tempo pelos maiores comandos da Terra, Mad Dog e Scorpion, ressurgiu novamente, desta vez com muita raiva e sede de vingança. Seus exércitos estão marchando pelas cidades com a intenção de exterminar a raça humana. Dois soldados, Jimbo e Sully, saíram para confrontar Red Falcon e salvar o que resta do mundo de seus planos hediondos.
Como seus antecessores, The Alien Wars é um side-scrolling de tiro com muita ênfase na ação. O protagonista pode carregar duas armas e disparar em oito direções quando estiver parado. O design de fase é mais complexo e oferece mais oportunidades de interação. Novas habilidades incluem escalar em paredes, agarrar postes e conduzir tanques de guerra. Partes do cenário podem ser destruídas.
Dois estágios têm uma visão de cima para baixo e são jogados de forma diferente dos níveis de rolagem lateral, com mais liberdade de exploração e a necessidade de completar os objetivos da missão, em vez de simplesmente avançar em uma direção e matar todos os inimigos. The Alien Wars ganhou uma versão para os portáteis da Nintendo Game Boy e Game Boy Advance, e também está disponível no Virtual Console da Nintendo para Wii, Wii U (versão SNES e GBA) e 3DS.